- HIPÓTESE ARTICULATA x ECDYSOZOA
O posicionamento dos artrópodes no reino animal é incerta, embora classicamente tenha os considerado como animais protostômios relacionados com o filo Annelida. Ambos grupos formam um grupo maior chamado Articulata, juntamente com os moluscos.
Contudo, diversas análises morfológicas baseadas em princípios cladistas têm chegado a resultados contraditórios com respeito às relações filogenéticas entre anelídeos e artrópodes. A hipótese alternativa enuncia que os artrópodes e grupos afins, como Tardígrada e Onycophora, não estão diretamente relacionados com os Annelida, mas com uma série de grupos de pseudocelomados, constituindo um clado denominado Ecdysozoa.
As sinapomorfias compartilhadas pelos ecdysozoários são, principalmente: ausência de cílios locomotores, cérebro tripartido e realização de muda. Contudo, ao considerarmos tais características como sinapomorfias, a localização de outro grupo é questionada: Gastrotricha. Os animais pertencentes a este último grupo possuem um posicionamento “dúbio” na filogenia, pois não realizam muda, são dotados de estômago com cerdas e cérebro periesofágico. Para que Gastrotricha seja colocado no grupo dos Ecdysozoa, deveríamos pensar que houve reversão para alguma características neste clado. Como nas maioria das análises evolutivas, não há apenas uma única hipótese. Podemos considerarmos a presença decérebro periesofágico como sinapomorfia de Gastrotricha + Ecdysozoa, sumindo em Panarthropoda, o cérebro de Gastrotricha é homólogo ao de Introverta. Ou então, se colocarmos como sinapomorfia de Ecdysozoa a presença de cérebro tripartido, com o cérebro periesofágico surgindo em Gastrotricha e em Introverta, temos que o cérebro destes dois últimos são órgãos convergentes.